Horvatić, Anita; Dodig, Ivana; Bujak, Maro; Šaban, Nina Proteomika tumora prostate. In: Znanstveni susreti 3. vrste (7 July 2011 - 8 July 2011) Zagreb, Hrvatska. (Unpublished)
|
PDF
- Published Version
- poster
Download (1MB) | Preview |
Abstract
Proteomika je znanstvena disciplina čija je svrha molekularna karakterizacija proteoma, te je ključna za otkrivanje biomarkera i mehanizama bolesti. Izrada diferencijalnog proteomskog profila zasniva se na analizi promjene ekspresije proteina u zdravim i bolesnim stanicama, tkivima ili tjelesnim tekućinama. Kako bi se postigla selektivna i osjetljiva analiza proteina, proteine je nakon izolacije iz uzorka najprije potrebno razdvojiti separacijskim tehnikama poput dvodimenzionalne gel elektroforeze (2-DE) ili tekućinske kromatografije vezane sa spektrometrijom masa. Iz tumorskog i zdravog tkiva pacijenata oboljelih od tumora prostate izolirani su proteini koji su potom razdvojeni tehnikom 2-DE. U prvoj dimenziji proteini su odijeljeni na temelju njihovih izolelektričnih točaka u gradijentu pH 3-10, a u drugoj dimenziji na temelju molekulske mase pomoću SDS-PAGE. Dobiveni gelovi obojani su srebrom, te su denzitometrijski analizirani pomoću za to specijaliziranog uređaja (VersaDoc Imaging System) i software-a (PDQuest verzija 7.4.0.). Međusobnom usporedbom gelova ustanovljeno je postojanje 54 diferencijalno eksprimirana proteina koji su analizirani pomoću spektrometrije masa (4800 plus MALDI TOF/TOF) i identificirani pretragom proteinskih baza podataka (NCBI, MSDB i SwissProt). Razlike u ekspresiji proteina bitne su za klasifikaciju pacijenata, kao i odabir terapije. Daljnjim ispitivanjima neki od identificiranih proteina mogli bi poslužiti kao biomarkeri u praćenju progresije bolesti, te za razvoj i testiranje novih specifičnih protutumorskih lijekova.
Item Type: | Unpublished conference/workshop items or lecture materials |
---|---|
Uncontrolled Keywords: | proteomics of prostate tumors; biomarker |
Subjects: | BIOMEDICINE AND HEALTHCARE > Clinical Medical Sciences > Oncology |
Divisions: | Division of Molecular Medicine |
Depositing User: | Anita Horvatić |
Date Deposited: | 21 Sep 2012 11:16 |
URI: | http://fulir.irb.hr/id/eprint/306 |
Actions (login required)
![]() |
View Item |