hrvatski jezikClear Cookie - decide language by browser settings

Structural characterization of bacterial glycine:[carrier protein] ligase and its complexes with substrates

Ivić, Nives (2013) Structural characterization of bacterial glycine:[carrier protein] ligase and its complexes with substrates. Doctoral thesis, Sveučilište u Zagrebu, Prirodoslovno-matematički fakultet.

[img]
Preview
PDF - Published Version
Download (12MB) | Preview

Abstract

Nedavno je otkrivena nova porodica enzima sličnih metanogenom tipu seril-tRNA-sintetaza. Nazvani aminokiselina:[protein-nosač]-ligaze, ovi homolozi umjesto serina tioesterski vežu glicin ili alanin na odgovarajući protein-nosač (CP) umjesto na tRNA. U ovom radu je strukturno okarakteriziran član te porodice ; glicin:[protein-nosač]-ligaza 1 (Bj Gly:CP-ligaza 1) iz bakterije Bradyrhizobium japonicum. Usporedba kristalnih struktura Bj Gly:CP-ligaze 1 i metanogenog tipa seril-tRNA-sintetaze je otkrila strukturnu očuvanost katalitičke domene i aktivnog mjesta enzima. Strukture Bj Gly:CP-ligaze 1 u kompleksu s malim supstratima (ATP-om i analogom glicil-adenilata) su ukazale na potencijalne aminokiseline odgovorne za diskriminaciju glicina i očuvanost mehanizma aktivacije glicina. Analiza strukture kompleksa Bj Gly:CP-ligaze 1 i odgovarajućeg CP-a je otkrila međudjelovanje proteina isključivo preko CP-vezne zavojnice karakteristične za aminokiselina:[protein-nosač]-ligaze. Dizajnirana je hibridna Gly:CP-ligaza u kojoj je CP-vezna zavojnica iz Bj Gly:CP-ligaze 1 zamijenjena odgovarajućom iz Agrobacterium tumefaciens alanin:[protein-nosač]-ligaze. Usporedbom kompleksa ligaza s odgovarajućim CP-om razjašnjena je strukturna osnova na temelju koje aa:CP-ligaze razlikuju protein-nosače.

Item Type: Thesis (Doctoral thesis)
Uncontrolled Keywords: biomacromolecular crystallography; amino acid:[carrier protein] ligase; seryl-tRNA sinthetase homolog; carrier protein; Bradyrhizobium japonicum
Subjects: NATURAL SCIENCES > Chemistry
Divisions: Division of Physical Chemistry
Projects:
Project titleProject leaderProject codeProject type
Protein-ligand interactions at atomic level (Protein-ligand međudjelovanja na atomnoj razini)-Marija Luić098-1191344-2943MZOS
Depositing User: Nives Ivić
Date Deposited: 05 Oct 2015 14:29
Last Modified: 06 Nov 2015 11:01
URI: http://fulir.irb.hr/id/eprint/2150

Actions (login required)

View Item View Item

Nema podataka za dohvacanje citata

Downloads

Downloads per month over past year